Werkstudent

Werkstudent*in Bioinformatik

Die Fraunhofer-Gesellschaft (www.fraunhofer.de) ist eine der weltweit führenden Organisationen für anwendungsorientierte Forschung. 74 Institute entwickeln wegweisende Technologien für unsere Wirtschaft und Gesellschaft – genauer: 30 000 Menschen aus Technik, Wissenschaft, Verwaltung und IT. Sie wissen: Wer zu Fraunhofer kommt, will und kann etwas verändern. Für sich, für uns und die Märkte von heute und morgen.

Zukunft. Gemeinsam. Entwickeln.

Im Mittelpunkt der Forschungsarbeit des Fraunhofer-Instituts für Nachrichtentechnik – HHI stehen exzellente Forschung und Innovationen. Dabei sind wir weltweit führend in der Erforschung von mobilen und optischen Kommunikationsnetzen und -systemen sowie dem Maschinellen Lernen, Computer Vision und der Kompression von digitalem Video. Wir versprechen Ihnen exzellente Kontakte in das relevante industrielle und wissenschaftliche Umfeld. Im Rahmen unseres Projekts mit dem Startup TestBlu suchen wir eine*n Werkstudent*in im Bereich Bioinformatik zur Unterstützung bei der NGS-Datenanalyse, der Entwicklung bioinformatischer Pipelines sowie der Datenaufbereitung für die KI-gestützte Interpretation im Rahmen des CaniSense-Diagnostik-Workflows. Werden Sie Teil unseres Teams und gehen Sie mit uns auf Forschungs- und Innovationsreise!

 

Hier sorgen Sie für Veränderung

• Entwicklung und Pflege von Bioinformatik-Skripten, Tools und Analyse-Pipelines
• Unterstützung bei der Verarbeitung und Qualitätskontrolle von Sequenzierungsdaten
• Aufbau und Optimierung von Pipelines, die NGS-Ergebnisse mit KI-Modellen verknüpfen
• Unterstützung bei cfDNA-, CNV-, Fragmentomik- und anderen biomarkerbezogenen Analysen
• Mithilfe bei der Datenaufbereitung, Merkmalsextraktion und Dokumentation
• Verbesserung der Workflow-Automatisierung und Reproduzierbarkeit
• Dokumentation von Pipelines, Analyseschritten und Ergebnissen 

 

Hiermit bringen Sie sich ein

Erforderlich:

• Masterstudium in Bioinformatik, Computational Biology oder einem verwandten Bereich der computergestützten Wissenschaften
• Erfahrung mit Python, der Analyse von NGS-Daten und bioinformatischen Workflows
• Vertrautheit mit Linux, Git/GitLab und Befehlszeilentools
• Strukturierte und lösungsorientierte Denkweise
• Interesse an KI-gestützter Diagnostik, Genomik und Flüssigbiopsie 

 

Wünschenswert:

• Erfahrung mit Workflow-Tools wie Nextflow, Snakemake oder Ähnlichem
• Kenntnisse in den Bereichen cfDNA, CNV-Analyse, Variant Calling oder Fragmentomik
• Erfahrung mit R, Bioconductor, pandas, scikit-learn oder Bioinformatik-Bibliotheken
• Verständnis für Datensicherheit und den Umgang mit Daten im Gesundheitswesen
• Kenntnisse in Docker oder Cloud-Umgebungen sind von Vorteil 

 

Was wir für Sie bereithalten

• Attraktives Gehalt
• Moderner und gut ausgestatteter Arbeitsplatz in zentraler Lage
• Gute und kooperative Arbeitsatmosphäre in einem internationalen Team
• Flexible Arbeitszeiten

 

Die Stelle ist zunächst 1 Jahr befristet. Eine Verlängerung ist explizit erwünscht. 

 

Wir wertschätzen und fördern die Vielfalt der Kompetenzen unserer Mitarbeitenden und begrüßen daher alle Bewerbungen – unabhängig von Alter, Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion, Weltanschauung, Behinderung sowie sexueller Orientierung und Identität. Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung bevorzugt eingestellt. Unsere Aufgaben sind vielfältig und anpassbar – für Bewerber*innen mit Behinderung finden wir gemeinsam Lösungen, die ihre Fähigkeiten optimal fördern.

Die monatliche Arbeitszeit beträgt 80 Stunden. Die Stelle kann auch in Teilzeit besetzt werden.

Mit ihrer Fokussierung auf zukunftsrelevante Schlüsseltechnologien sowie auf die Verwertung der Ergebnisse in Wirtschaft und Industrie spielt die Fraunhofer-Gesellschaft eine zentrale Rolle im Innovationsprozess. Als Wegweiser und Impulsgeber für innovative Entwicklungen und wissenschaftliche Exzellenz wirkt sie mit an der Gestaltung unserer Gesellschaft und unserer Zukunft. 

Bereit für Veränderung? Dann bewerben Sie sich jetzt, und machen Sie einen Unterschied! Nach Eingang Ihrer Online-Bewerbung erhalten Sie eine automatische Empfangsbestätigung. Dann melden wir uns schnellstmöglich und sagen Ihnen, wie es weitergeht. 

 

Fraunhofer-Institut für Nachrichtentechnik, Heinrich-Hertz-Institut HHI 

www.hhi.fraunhofer.de