Masterarbeit oder Forschungspraktikum - Entwicklung einer robusten Protein-Sekretionsstrategie mittels Laborautomatisierung

Als führende Forschungseinrichtung für mikrobielle Biotechnologie konzentrieren wir uns am Institut für Bio- und Geowissenschaften – Biotechnologie (IBG-1) auf molekulare und angewandte Mikrobiologie. In interdisziplinären Teams entwickeln wir dabei biotechnologische Prozesse für die Industrie von morgen, mit einem Fokus auf zunehmend automatisierte und miniaturisierte Experimente.

Die angebotene Masterarbeit ist Teil eines Projektes, dessen Ziel es ist, die Produktion heterologer Proteine nachhaltiger zu machen. Die so produzierten Proteine können zum Beispiel eingesetzt werden, um Lebensmittel sicherer und umweltfreundlicher zu machen, um Mikroplastik zu reduzieren, oder um antibiotikaresistente Keime zu bekämpfen. Für die nachhaltige Produktion dieser Proteine soll deren Sekretion durch den Expressions-Host Corynebacterium glutamicum optimiert werden.

Basierend auf vorangehender Forschung zum Einfluss von Sekretions-Signalpeptiden und Proteinsequenz auf die Sekretionsleistung, soll nun eine generalisierbare Strategie für die Sekretion verschiedener Zielproteine entwickelt werden. Um dieses Ziel zu erreichen, werden Hochdurchsatz-Methoden und hochmoderne Techniken der Laborautomatisierung eingesetzt.

Dieses Projekt ist Teil des Verbundprojekts Bioökonomie-Revier, welches den Strukturwandel im Rheinischen Braunkohlerevier vorantreiben und einen Beitrag zur Transition zu einer nachhaltigen Gesellschaft und Wirtschaftsweise leisten möchte. Mehr Informationen dazu finden Sie unter: https://www.biooekonomierevier.de/Biotechnologie_und_Kunststoffwirtschaft

Ihre Aufgaben im Team

Bei der ausgeschriebenen Stelle wird es schwerpunktmäßig darum gehen, Einflussfaktoren auf die Sekretionsleistung von Corynebacterium glutamicum zu untersuchen. Ein besonderes Augenmerk wird dabei darauf gelegt, eine Sekretionsstrategie zu entwickeln, die unabhängig vom gewählten Zielprotein zu guten Ergebnissen führt.

Zu Ihren Aufgaben im Rahmen des Projektes werden gehören:

• Molekularbiologische Erstellung von C. glutamicum Sekretionsstammbibliotheken mit Hilfe eines OpenTrons OT-2 Laborroboters
• Kultivierung der Stämme auf einer automatisierten Mikrokultivierungsplattform
• Quantifizierung der Sekretionsleistung mittels splitGFP-Assay und ggf. anderer Methoden
• Vorausschauende Planung von Experimenten unter Einbezug von Literaturrecherche
• Sorgfältige Dokumentation der durchgeführten Arbeiten und selbstständige Datenauswertung mit Python und MS Excel
• Präsentation der Arbeitsergebnisse in gruppeninternen Seminaren

Das bringen Sie mit

• Sie studieren Biologie, Biotechnologie, Molekularbiologie oder eine verwandte Disziplin im Masterstudiengang
• Sie konnten bereits Erfahrungen bei der Arbeit im Labor sammeln, z.B. bei Praktika oder Abschlussarbeit
• Sie sind bereit, sich in neue Methoden (z.B. Klonierung, Kultivierung, Datenanalyse) und grundlegende Programmierung (Python) einzuarbeiten und/oder bringen bereits Vorkenntnisse in diesen Bereichen mit
• Sie sind interessiert am Einsatz von Hochdurchsatz-Methoden im Labor und an der Optimierung biotechnologischer Prozesse
• Sie besitzen ein hohes Maß an Selbstständigkeit, Motivation und Zuverlässigkeit
• Sie zeigen eine sehr strukturierte, proaktive und ordentliche Arbeitsweise

Bitte geben Sie in Ihrer Bewerbung an, in welchem Zeitraum Sie an diesem Projekt arbeiten möchten.

Freuen Sie sich auf folgende Benefits

Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Sie erwartet ein vielseitiges Angebot:

• Sinnstiftende Aufgaben: Ihre Abschlussarbeit behandelt ein zukunftsorientiertes, gesellschaftlich relevantes Thema mit unmittelbarem Praxisbezug in einem internationalen Umfeld
• Praxisnähe: Bei uns sammeln Sie wertvolle Praxiserfahrungen neben dem Studium und wirken aktiv an interdisziplinären Projekten mit
• Wissenschaftliches Umfeld: Sie erwartet eine exzellente wissenschaftliche Ausstattung, moderne Technologien und eine qualifizierte Betreuung durch erfahrene Kolleg:innen
• Eigenverantwortung: Sie gestalten Ihre Aufgaben eigenständig – von der Vorbereitung bis zur Durchführung
• Erfolgreicher Einstieg: Uns ist es wichtig, dass Sie schnell im Team ankommen und strukturiert in Ihre Aufgaben eingearbeitet werden. Zudem begleiten wir Sie von Beginn an und erleichtern Ihnen den Start durch unsere Welcome Days und unseren Welcome Guide: https://go.fzj.de/willkommen
• Work-Life-Balance: Optimale Bedingungen für die Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienfreundliche Unternehmenspolitik. Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten ist grundsätzlich nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vorort-)Terminen gegeben
• Gesundheit & Wohlbefinden: Ihre Gesundheit liegt uns am Herzen. Freuen Sie sich auf ein umfangreiches betriebliches Gesundheitsmanagement mit vielfältigen Angeboten – z. B. durch Beachvolleyball-Platz, Laufgruppen, Yoga-Kurse und vieles mehr. Zusätzlich stehen Ihnen unser betriebsärztlicher Dienst sowie ein erfahrenes Team der Sozialberatung direkt vor Ort zur Seite
• Campus-Erlebnis: Unser Forschungscampus im Grünen schafft ideale Bedingungen für kollegialen Austausch und sportlichen Ausgleich direkt vor Ort. In unserer Kantine erwartet Sie ein vielfältiges Angebot – Ihre Mittagspause können Sie entspannt mit Seeblick genießen

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.

Über die folgenden Links erhalten Sie weitere Informationen zu Vielfalt und Chancengerechtigkeit: https://go.fzj.de/diversitaet sowie zur gezielten Förderung von Frauen: https://go.fzj.de/job-journey-women